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諾貝爾化學(xué)獎,,為何也青睞人工智能?|新京報(bào)專欄

諾貝爾化學(xué)獎,為何也青睞人工智能,?|新京報(bào)專欄▲戴維·貝克、德米斯·哈薩比斯和約翰·江珀,。圖/諾貝爾獎委員會官網(wǎng)2024年的諾貝爾化學(xué)獎,,也給了人工智能,。10月9日,,瑞典皇家科學(xué)院宣布將本年度諾貝爾化學(xué)獎授予三位科學(xué)家,其中,,一半授予美國華盛頓大學(xué)的戴維·貝克,,以表彰其在計(jì)算蛋白質(zhì)設(shè)計(jì)方面的貢獻(xiàn),另一半則共同授予英國倫敦谷歌旗下人工智能公司“深層思維”的德米斯·哈薩比斯和約翰·江珀,,以表彰其在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測方面的貢獻(xiàn),。無論貝克的蛋白質(zhì)設(shè)計(jì)發(fā)明,還是哈薩比斯和江珀的蛋白質(zhì)測定的發(fā)現(xiàn),,都極大地開拓了人類對蛋白質(zhì)的認(rèn)知,。蛋白質(zhì)不只是生命的基本物質(zhì),而且還有更多的作用,,如充當(dāng)激素,、信號物質(zhì)、抗體和不同組織的組成部分,。而深入了解蛋白質(zhì),,將給人類帶來更多更大的益處。人類可以創(chuàng)造蛋白質(zhì)2003 年,,貝克成功地使用一個(gè)人工智能模型設(shè)計(jì)了一種不同于任何其他蛋白質(zhì)的新蛋白質(zhì),。之后,他的研究小組創(chuàng)造了一個(gè)又一個(gè)富有想象力的蛋白質(zhì),,包括可用作藥物,、疫苗、納米材料和微型傳感器的蛋白質(zhì)。早在1998年,,貝克團(tuán)隊(duì)設(shè)計(jì)了稱為羅塞塔(Rosetta)預(yù)測蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和設(shè)計(jì)蛋白質(zhì)的軟件,。它可以通過修改氨基酸序列來設(shè)計(jì)出具有特定功能或性質(zhì)的蛋白質(zhì),如增強(qiáng)蛋白質(zhì)的穩(wěn)定性,、改變蛋白質(zhì)的結(jié)合親和力等,。2003年,貝克團(tuán)隊(duì)讓羅塞塔計(jì)算哪種類型的氨基酸序列可以產(chǎn)生所需的蛋白質(zhì),。羅塞塔不辱使命,,搜索了所有已知蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的數(shù)據(jù)庫,并尋找與所需結(jié)構(gòu)相似的蛋白質(zhì)短片段,。然后,,設(shè)計(jì)出了一個(gè)全新的與現(xiàn)在所有已知的蛋白質(zhì)完全不同的蛋白質(zhì),稱為Top7,。而且,,Top7的結(jié)構(gòu)是自然界中并不存在的獨(dú)特結(jié)構(gòu),它有93個(gè)氨基酸,,比以前設(shè)計(jì)生產(chǎn)的任何蛋白質(zhì)都大,。這個(gè)發(fā)現(xiàn)的重要意義在于,人類可以像自然一樣創(chuàng)造蛋白質(zhì),,但不同于自然創(chuàng)造蛋白質(zhì)是隨機(jī)的,,而是有目的的,能夠研發(fā)有針對性和有效的藥物,。例如,,研發(fā)破除細(xì)菌耐藥的抗生素,以及治療癌癥和艾滋病的藥物,。預(yù)測蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的新方法此次共享一半諾獎的哈薩比斯和江珀,,則創(chuàng)建了一個(gè)人工智能模型,從根本上改變了AI模型對蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的測定,。在蛋白質(zhì)中,,氨基酸以長鏈的形式連接在一起,這些長鏈折疊形成三維結(jié)構(gòu),,對蛋白質(zhì)的功能起決定性作用,。從20世紀(jì)70年代以來,研究人員一直試圖從氨基酸序列中預(yù)測蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu),,但這似乎難于上青天,。為了解決蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)檢測問題,1994年,,以美國馬里蘭大學(xué)約翰·莫爾特為首的一些科學(xué)家啟動了一個(gè)名為蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測關(guān)鍵評估(CASP)項(xiàng)目,,之后發(fā)展成為一項(xiàng)競賽,。幾年前,研究人員在CASP競賽中人工預(yù)測蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)最多只能達(dá)到40%的準(zhǔn)確率,。但哈薩比斯團(tuán)隊(duì)借助他們的AI模型阿爾法折疊對蛋白質(zhì)的預(yù)測準(zhǔn)確率達(dá)到了近60%,,能夠預(yù)測過去已經(jīng)鑒定出的幾乎所有2億種蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)。而要全面了解蛋白質(zhì)的功能,,必須對其結(jié)構(gòu)的預(yù)測準(zhǔn)確率達(dá)到90%,。之后,哈薩比斯和江珀聯(lián)手研發(fā)了新的AI模型阿爾法折疊-2,。2020年,,他們帶著這一AI模型參加CASP,評估結(jié)果時(shí)幾乎讓所有人震驚,,他們明白生物化學(xué)50年的挑戰(zhàn)已經(jīng)結(jié)束,。在大多數(shù)情況下阿爾法折疊-2的性能幾乎與X射線晶體學(xué)一樣好。這個(gè)發(fā)明的意義在于,,人類有了預(yù)測蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的新方法,。過去,測定蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)有三大手段,,X射線晶體學(xué),、核磁共振技術(shù)和冷凍電鏡三維重構(gòu)技術(shù)。這些方法都有其優(yōu)點(diǎn)和缺陷,,不同的研究對象需要采用不同的方法,。阿爾法折疊的橫空出世,幾乎克服了現(xiàn)有的幾種測定蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的弱點(diǎn),,在準(zhǔn)確性,、速度,、效率,,以及適用性上都體現(xiàn)了優(yōu)勢。這項(xiàng)發(fā)明的重要意義,,同樣體現(xiàn)在研發(fā)藥物,、診治疾病方面。如艾滋病病毒表面突起蛋白gp120主要與人免疫T細(xì)胞表面蛋白結(jié)合,,如果進(jìn)一步確定gp120蛋白的結(jié)構(gòu),,就可以設(shè)計(jì)出阻止其與T細(xì)胞結(jié)合的藥物,以防治艾滋病,。此外,,更要看到的是,今年的物理學(xué)獎和化學(xué)獎都授予了與人工智能相關(guān)的研究結(jié)果,,這或許意味著,,人工智能不只是未來人們工作和研究的工具,,還是人類社會發(fā)展不可或缺的利器。撰稿 / 張?zhí)锟保破兆髡撸┚庉?/ 徐秋穎校對 / 賈寧

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