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人民網(wǎng)

科學(xué)家用人工智能設(shè)計全新抗體

科技日報北京3月20日電(記者劉霞)據(jù)英國《自然》雜志網(wǎng)站19日報道,,美國華盛頓大學(xué)科學(xué)家首次使用生成式人工智能AI)工具,,幫助他們制造全新抗體。研究團隊表示,,AI設(shè)計抗體或能更好靶向一些很難被攻擊的藥物標(biāo)靶,,但這些抗體距離臨床應(yīng)用還有很長的路要走。研究團隊使用了他們?nèi)ツ臧l(fā)布的AI工具RFdiffusion,。該工具使研究人員能設(shè)計出可與另一種挑選出來的蛋白質(zhì)緊密結(jié)合的迷你蛋白質(zhì),。這些定制蛋白質(zhì)與抗體沒有相似之處??贵w通過軟環(huán)識別目標(biāo),,而軟環(huán)很難用AI建模。為解決這一難題,,研究人員利用在數(shù)千個實驗中確定的附著在標(biāo)靶的抗體結(jié)構(gòu),,以及其他抗體樣相互作用的真實數(shù)據(jù),,訓(xùn)練RFdiffusion神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),,并對其進行了微調(diào),。用這種方法,他們設(shè)計出了數(shù)千種抗體,。它們能識別幾種細(xì)菌和病毒蛋白質(zhì)(包括新冠病毒和流感病毒用來入侵細(xì)胞的蛋白質(zhì)),,以及一個癌癥藥物標(biāo)靶的特定區(qū)域。研究人員也在實驗室中制造出了抗體,,并測試了其能否與正確的標(biāo)靶結(jié)合,。結(jié)果顯示,,每100種AI設(shè)計的抗體,就有一種如預(yù)期那樣起作用,,但這一成功率低于使用AI設(shè)計的其他類型蛋白質(zhì)。他們還使用冷凍電子顯微鏡技術(shù),,確定了其中一種流感抗體結(jié)構(gòu),發(fā)現(xiàn)它識別出了目標(biāo)蛋白質(zhì)的預(yù)期部分,。研究團隊希望RFdiffusion能幫助尋找已被證明具有挑戰(zhàn)性的藥物靶點,如控制細(xì)胞對外部化學(xué)物質(zhì)反應(yīng)的膜蛋白——G蛋白偶聯(lián)受體,。但團隊表示,,從RFdiffusion設(shè)計抗體到實際應(yīng)用還要經(jīng)歷很長時間。一方面,,起作用抗體與靶點結(jié)合力并不是特別強。另一方面,,還需要將治療抗體的序列修飾為與人類天然抗體類似的序列,,以免引發(fā)免疫反應(yīng),。來源:科技日報

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