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人工智能助力RNA病毒研究

【瞧,!我們的前沿科技】 光明日報訊(記者吳春燕,、唐一歌 通訊員朱嘉豪,、李建平)10月9日,,中山大學(xué)醫(yī)學(xué)院施莽教授團隊與阿里云李兆融團隊在《細胞》雜志發(fā)表論文,,報告了全球范圍的180個超群,、16萬余種的RNA病毒發(fā)現(xiàn),,大幅擴展全球RNA病毒的多樣性,。該研究將人工智能技術(shù)應(yīng)用于病毒鑒定,,探索了病毒學(xué)研究的新路徑,。傳統(tǒng)的病毒發(fā)現(xiàn)方法高度依賴既有知識,面對RNA病毒這種高度分化,、種類繁多且容易變異的病毒識別效率低,。在該研究中,,研究團隊開發(fā)了一種人工智能算法,,其能對病毒和非病毒基因組序列深度學(xué)習(xí),并自主判斷病毒序列,。利用這套算法,,研究團隊在來自全球生物環(huán)境樣本的10487份RNA測序數(shù)據(jù)中發(fā)現(xiàn)了超過51萬條病毒基因組,代表超過16萬個潛在病毒種及180個RNA病毒超群,。其中23個超群無法通過序列同源方法識別,,被稱為病毒圈的“暗物質(zhì)”。通過進一步分析,,研究團隊報告了迄今最長的RNA病毒基因組,,長度達到47250個核苷酸;發(fā)現(xiàn)了超出以往認知的基因組結(jié)構(gòu),,展現(xiàn)出RNA病毒基因組進化的靈活性,;識別到多種病毒功能蛋白,特別是與細菌相關(guān)的功能蛋白,,進一步表明還有更多類型的RNA噬菌體亟待探索,;發(fā)現(xiàn)在南極底泥、深海熱泉,、活性污泥和鹽堿灘等極端環(huán)境中,,RNA病毒的數(shù)量和多樣性仍然較高?!叭斯ぶ悄艿乃惴P湍軌蛲诰虺鑫覀冎昂雎曰蚋静恢赖牟《?,這在疾病防控和新病原的快速識別中尤為重要。特別是在疫情暴發(fā)時,,人工智能的速度和精度可以幫助科學(xué)家更快地鎖定潛在病原體,?!笔┟дf?!豆饷魅請蟆罚?024年10月11日 09版)來源:光明網(wǎng)-《光明日報》

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